Самосборка холестерольного ядра липопротеина низкой плотности

 

Самосборка холестеринового ядра: 
1600 холестерил олеат (CO), 180 триолеат (TO), 600 холестерол (CHOL).

Моделирование проводилось в пакете молекулярного моделирования GROMACS 4.6 с использованием крупнозернистого метода молекулярной динамики (силовое поле) dryMARTINI - метод с неявным учётом растворителя[1].

Температура 310 К, Периодический ящик 30х30х30 нм.

 

 

1. Clément Arnarez, Siewert J. Marrink and all. Dry Martini, a Coarse-Grained Force Field for Lipid Membrane Simulations with Implicit Solvent // J. Chem. Theory Comput., 2015, 11 (1), pp 260–275 

X
Predictive multiscale modeling in life sciences and sphere of high technologies