«Многопроцессорный программно-информационный комплекс моделирования молекулярных систем для супер-ЭВМ «KVAZAR»». Свидетельство о государственной регистрации программы для ЭВМ № 2014610217. Авторы: О.Е. Глухова, Г.В. Савостьянов, Р.А. Сафонов.
ПВК «KVAZAR» обладает рядом преимуществ над существующими аналогами, одним из которых является успешное сочетание в рамках одной программы вычислительных возможностей разнообразных методов молекулярного моделирования. Некоторые успешные программные пакеты являются закрытыми (GAUSSIAN), в связи с чем отсутствует возможность внесения поправок в вычислительный процесс. Большинство программ с открытым исходным кодом реализованы на языках программирования C/C++/Fortran (LAMMPS, GROMACS) которые не очень удобны для гибкого манипулирования возможностями пакета на уровне корректировки кода. ПВК KVAZAR содержит модуль, реализующий уравнения классической молекулярной механики, который может быть сконфигурирован для большинства молекулярно-механических силовых полей (AMBER, CHARMm и т.д.), и модуль, реализующий полуэмпирический квантово-химический метод сильной связи, который может быть сконфигурирован для различных типов задач. Вычислительные модули комплекса адаптированы для высокопроизводительных вычислений, в том числе на GPU. Наиболее критичные к производительности вычислительные модули реализованы на языке программирования C++. Основные модули реализованы на динамическом языке высокого Python, который позволяет обеспечить их гибкость и удобный скриптовый доступ для внедрения экспериментальных подходов.
