Статья “Расчет переноса электрона в рутениум-модифицированных производных цитохрома b562” авторов Т.Р. Прытковой (ChapmanUniversity, USA), В.В. Шунаева, О.Е. Глуховой и И.В. Курникова (Carnegie Mellon University, United States) посвящена изучению реакции переноса электрона в рутениум-модифицированных производных цитохрома b562 с использованием усовершенствованных методов моделирования. Авторы работы провели серию неэмпирических расчетов взаимодействия донор/акцептор внутри фрагментов протеина и провели сравнение вычисленных электронных скоростей с имеющимися экспериментальными данными. Предложенный в работе подход учитывает кофактор электронной структуры и влияние раствора на донорно-акцепторные взаимодействия. Это позволяет прогнозировать абсолютные значения скоростей электронного переноса в отличие от других вычислительных методов, которые дают только качественные результаты.
Полученные расчеты с хорошей точностью повторяют экспериментальные значения скоростей электронного переноса. Обнаружено, что перенос электронов в некоторых производных цитохрома b562 главным образом обсуловлен «сокращенными» конформациями, в которых донорно- акцепторные взаимодействия опосредованы взаимодействием несвязанных Ru-лигандов с группами поверхности белка.
